CentOS 6 でパーミッションに「.」がつくようになったそうだ。
selinux 管理下にあるものがつくらしい。

[root@**** ~]# ls -ld /home
drwxr-xr-x. 14 root root 4096 8月 19 12:15 2013 /home/

「tkak’s tech blog」に掲載されていました。
http://tkak.hatenablog.com/entry/2013/01/04/151248

まとめて、「.」を取り除くためには、
# find /home/data -exec setfattr -x security.selinux {} \;
のようにすれば、”/home/data” 内の全てのファイルやディレクトリについて、
「.」を取ってくれそうです。